Вы сравниваете пустые форумы. При большом количестве пользователей (500 онлайн) ситуация изменится не в пользу phpbbex по производительности.
Вообще, глупо сравнивать phpbb 3.0 и phpbbex в данном аспекте, они не сильно различаются, лишь толикой.
Одно дело, когда в phpbbex уже встроены некоторые "моды", "расширения" и всякие плюшки. А другое дело ставить их вручную на голый phpbb.
Разумеется, phpbbex, когда базовый оптимизированнее, чем phpbb 3.0 и тем паче 3.1 при пустой базе, нулевом онлайне, отдаче главной. Нельзя прикинуть нагрузку при одновременных и различных действиях 100 человек на форуме.